Услышь нашу смиренную молитву, Господи!
Мы молим за наших друзей-зверей,
Особенно за тех, кто страдает,
За всех, на кого охотятся, кто потерялся,
Кого бросили, кто напуган или голоден;
За всех, кто должен быть усыплён.
Сжалься над ними, будь милостив!
А тем, кто должен о них заботиться,
Даруй сердца, полные сострадания,
Дай им добрые руки, подскажи ласковые слова.
Да будем мы истинными друзьями для зверей!
Да разделим милость Твою и благодать!
Аминь!
Источник, а также текст молитвы на английском и немецком
В православии принято считать покровителями животных многих святых.
Иоанну Воину (в Москве его храм находится на Якиманке) молятся за пропавших, в пристройстве и других нуждах помогают Николай Угодник и Пресвятая Богородица.
А именно покровителми животных считаются святые Флор и Лавр,

изначально они были покровителями домашнего скота и лошадей, но исцеляли и других домашних животных. 23 марта 2011 года Святейший Патриарх Кирилл издал указ, согласно которому день памяти святых мучеников Флора и Лавра (18 /31 августа) благословляется считать церковным праздником ветеринаров на канонической территории Русской православной церкви.
В Москве ныне существует действующая церковь, в которой есть придел, освященный в честь свв. Флора и Лавра. По своему главному престолу эта церковь называется "Всех скорбящих радость" и находится на Зацепе, неподалеку от Павелецкого вокзала, на современной Дубининской улице (бывшая Коломенская-Ямская ул.)
Кроме них за животных можно молиться св. Власию Севастийскому.

Святой Власий жил в пещерах в лесу во время гонения на христиан.Однажды львица пришла к его пещере со львятами.Святой испугался,но бежать было некуда,и львица стала носом подталкивать львят к святому.И он понял,что они слепые от рождения---ничего не видят с открытыми глазами.Львица легла у ног святого и из глаз у нее текли слезы.Она просила святого помочь ей.Он помолился к Господу Иисусу Христу и они прозрели.На следующий день львица принесла ему шкуру неведомого зверя и он до смерти ей укрывался.С тех пор каждое утро к его пещере приходили раненые и больные животные, и он исцелял и благословлял их.
На территории России есть много посвящённых ему храмов, один из них в Москве- Гагаринский переулок, 20